受天候異常旱災影響，日月潭水位從今年初的正常水位，至5月30日降低至標高733公尺之百年歷史未見之低水位紀錄(降低14公尺，約5層樓高)，為維護旅遊安全及國家風景區品牌，交通部觀光局責請日月潭國家風景區管理處(以下稱日管處)從速修復。日管處為遊客遊湖安全考量，進行安全維護及防護相關工作(包含設置引橋斜坡防滑條、設置警示帶、協調各船公司船席位變更及安排保全人員控制引橋行走人數等)，並協調遊船業者於4月1日起逐步封閉碼頭。6月1日起因連日豪雨水位急速回升後，水社、玄光、朝霧、伊達邵等主要碼頭設施，因水位驟降驟升導致嚴重受損，日管處即著手邀集專業工程顧問公司及水域施工廠商討論搶修復原及修復計畫。
為爭取時效儘速恢復碼頭營運，日管處辦理緊急四大碼頭修復作業，並協調施工廠商，在確保工程安全、品質之前提下，增加機具、工班、工作面及工時，並逐次檢討調整工程排程以加速辦理期程，過程中並經歷颱風及午後山區降雨之影響但仍順利克服。又因應疫情解封措施，在顧慮做好遊客服務及安全管制前提下，於110年7月27日防疫微解封開放包船之時，完成四大碼頭第一階段之修復，使碼頭可提前提供遊客及班船基本營運使用。後續並數次檢討調整縮短工程排成，預定9月13日完成，在不分平假日全力趕工下，幾經努力目前已於9月8日提前完成四大碼頭之損壞修復作業，可提供遊客安全又舒適之上下船服務功能。
藉由本次百年旱象碼頭損壞之經驗，察覺碼頭設施因施作年份不一造成規格大小之差異，致相關浮排設施於受損時無法及時有效進行替換，日管處已就整體碼頭設備進行檢討，研擬建置碼頭設施系統化及模組化型式，以強化日月潭碼頭服務設施功能及利後續可能損壞時之緊急更換。另因應未來極端氣候導致水位下降之可能再次發生，將多元面向進行通盤檢討:管理面向將研擬碼頭預警機制，以防止浮排可能觸底破壞之情形；工程面向將依水位變化設置防止引橋損壞之設施；溝通面向將協調業者及遊艇公會訂定碼頭服務之應變機制，期未來再次遭遇嚴峻旱象時可有效管理各碼頭設施不再受到此次之嚴重損壞。
